Στις 9 Ιουλίου 2009, για πέμπτη φορά από την αρχή του έτους και δεύτερη σε διάστημα 40 ημερών, άγνωστοι δράστες έσπασαν δύο τάφους στο εβραϊκό νεκροταφείο Ιωαννίνων. Η νέα βεβήλωση του νεκροταφείου προκάλεσε αισθήματα οργής και αγανάκτησης στον Ελληνικό Εβραϊσμό. 

Η αντίδραση του Κ.Ι.Σ. ήταν άμεση με επιστολές που απέστειλε στο Νομάρχη Ιωαννίνων κ. Αλέξανδρο Καχριμάνη, στο Δήμαρχο Ιωαννιτών κ. Νικόλαο Γκόντα και στους Αστυνομικούς Διευθυντές Ιωαννίνων και Ηπείρου. Στην επιστολή, μεταξύ άλλων, το Κ.Ι.Σ. επισημαίνει: «…Η αδιαφορία των τοπικών αρμοδίων Αρχών στις αλλεπάλληλες διαμαρτυρίες του προέδρου της Ισραηλιτικής Κοινότητας Ιωαννίνων, καθώς και η δυστοκία στη λήψη κι εφαρμογή αποτελεσματικών μέτρων για την αντιμετώπιση του αποτρόπαιου αυτού αντισημιτικού φαινομένου, μόνον ως εμπαιγμός μπορεί να εκληφθεί. Εμπαιγμός που δεν συνάδει ούτε με την μακραίωνη ιστορία των Γιαννιωτών Εβραίων, ούτε με το αίσθημα της τοπικής κοινωνίας -όπως έχει εκφραστεί και μέσω του Τύπου κατά τις πρόσφατες ντροπιαστικές επιθέσεις βανδαλισμού του νεκροταφείου.

Ο Ελληνικός Εβραϊσμός, τον οποίο το Συμβούλιό μας εκπροσωπεί, θεωρεί πλέον ως περιττές τυχόν δηλώσεις καταδίκης και αναμένει ενημέρωση επί των μέτρων που θα αναληφθούν άμεσα και τα οποία θα οδηγήσουν στη σύλληψη και τιμωρία των δραστών αλλά και στην αποτροπή παρόμοιων ενεργειών στο μέλλον».
Επίσης, ο πρόεδρος του Κ.Ι.Σ. κ. Μωϋσής Κωνσταντίνης απέστειλε επιστολή προς τον υπουργό Εσωτερικών κ. Προκόπη Παυλόπουλο σχετικά με τη νέα βεβήλωση.
 
H Αστυνομική Διεύθυνση Ιωαννίνων, σε επιστολή της προς το Κ.Ι.Σ., ενημερώνει ότι από τις 3.6.09 (μετά δηλαδή το βανδαλισμό του Ιουνίου), διατάχθηκε η φρούρηση του νεκροταφείου κατά το νυχτερινό ωράριο και η επιτήρηση από πεζές περιπολίες κατά το υπόλοιπο χρονικό διάστημα της ημέρας. Επίσης, στην επιστολή επισημαίνεται η ανάγκη επισκευής τμήματος του περιμετρικού τοίχου και τοποθέτησης συστήματος ασφαλείας, καθώς και ότι «δεν κατέστη δυνατή η ανακάλυψη και ο εντοπισμός των δραστών των εν λόγω αξιόποινων πράξεων».
 
Με το θέμα ασχολήθηκε και πάλι ο  Τύπος των Ιωαννίνων με εκτενή δημοσιεύματα. Η ιστοσελίδα www.ioanninatoday.gr δημοσίευσε δήλωση του πρόεδρου της Ι.Κ. Ιωαννίνων κ. Μωϋσή Ελισάφ στην οποία αναφέρεται χαρακτηριστικά: «Δεν υπάρχει καμία αμφιβολία ότι οι επανειλημμένες βεβηλώσεις του εβραϊκού νεκροταφείου της πόλης μας είναι έργο ακροδεξιών φασιστικών συμμοριών. Οι ίδιες αυτές ομάδες εξάλλου φροντίζουν ανά διαστήματα να αφήνουν τα βέβηλα ίχνη τους με την αναγραφή των κλασικών συμβόλων της μισαλλοδοξίας και του φυλετικού μίσους (με αγκυλωτούς σταυρούς και ανάλογα σύμβολα). Οι μέσα σε λίγους μήνες πολλαπλοί βανδαλισμοί με εκτεταμένες καταστροφές τάφων και μνημείων στο κέντρο της πόλης μπορεί να μην είναι άσχετοι με τη γενικότερη πολιτική κατάσταση και την άνοδο της ακροδεξιάς που με πρόσχημα την ‘’ασφάλεια’’ των πολιτών πρωτοστατεί στην αναβίωση μιας ιδεοληπτικής γλώσσας με την καλλιέργεια φοβικών συνδρόμων κατά των μεταναστών, των αλλόθρησκων, των ξένων , των γενικώς “μη δικών μας”.  Σε αυτά τα πλαίσια προβάλλονται και οι στερεότυπες ιδεολογίες που δαιμονοποιούν την εβραϊκή παρουσία σε ορισμένα στρώματα της κοινωνίας. Έτσι δεν μπορεί κανείς να αγνοήσει την ιδιαίτερα προκλητική συμπεριφορά ορισμένων συμπολιτών μας που για την εξυπηρέτηση προσωπικών τους συμφερόντων δεν διστάζουν να καταφύγουν σε ένα αγοραίο ρατσιστικό αντισημιτισμό με επίκεντρο το εβραϊκό νεκροταφείο, σε ύβρεις, συκοφαντίες, μηνύσεις και οι οποίοι τώρα επιχαίρουν για τους καρπούς των πράξεων τους. Πρέπει, ωστόσο, να επισημανθούν και οι τεράστιες ευθύνες των αρχών ασφαλείας, οι οποίες παρά τις επανειλημμένες εκκλήσεις της Ισραηλιτικής Κοινότητας, αλλά και την αυστηρή κριτική φορέων της πόλης και των μέσων μαζικής επικοινωνίας δείχνουν να παρατηρούν αμήχανα ως απλοί θεατές τις επανειλημμένες βεβηλώσεις του εβραϊκού νεκροταφείου που σημαδεύουν τη φυσιογνωμία της πόλης και εκθέτουν τις αρχές της. Έργο των δυνάμεων ασφαλείας είναι τόσο η προστασία των πολιτών, καθώς και των ιερών χώρων και μνημείων όσο και η αποκάλυψη και παραπομπή στη δικαιοσύνη των ενόχων…».
 
Τοπικές αντιδράσεις: Ο βουλευτής του ΠΑΣΟΚ κ. Μιχάλης Παντούλας καταδίκασε την επίθεση στο εβραϊκό νεκροταφείο Ιωαννίνων και στη σχετική ανακοίνωσή του επισημαίνει: "Η επίθεση που, για πολλοστή φορά, δέχτηκε το εβραϊκό νεκροταφείο Ιωαννίνων δεν μπορεί να αφήσει κανέναν απαθή. Είναι αδιανόητο, κάθε τρις και λίγο, να βεβηλώνονται τάφοι και οι δράστες να μένουν ακόμη ασύλληπτοι. Κάτι δεν πάει καλά σε αυτή την πόλη. Για να συμβαίνουν αυτές οι αθλιότητες κάποιοι προσφέρουν ιδεολογικό υπόβαθρο, άλλοι - φορείς και πρόσωπα - με τη σιωπή τους ουσιαστικά τις επιδοκιμάζουν, ενώ η αστυνομία θεάται απλώς τα γεγονότα. Ο πλούτος και η περηφάνια των Ιωαννίνων είναι η διαχρονική ώσμωση ανθρώπων και πολιτισμών. Εάν δεν αντιδράσουμε τώρα, με όση δύναμη διαθέτει ο καθένας, τότε θα μας βαραίνει όλους η ντροπή για την ασυλλόγιστη απώλεια μέρους της συνείδησης και της ταυτότητας της “μικρής μας πόλης”».  
Καταδικαστικές ανακοινώσεις εξέδωσε επίσης ο ΣΥΡΙΖΑ Ιωαννίνων τονίζοντας πως «οι ευθύνες που φέρουν αστυνομία, Δήμος και Νομαρχία είναι τεράστιες γιατί παρά τις συνεχείς εκκλήσεις παραμένουν αμέτοχοι μπροστά στους συνεχιζόμενους βανδαλισμούς των νεοναζί», καθώς και η ΑΝΤΑΡΣΥΑ Ιωαννίνων που «καλεί σε αφύπνιση κάθε δημοκράτη πολίτη».